穗深城际铁路将于7月17日起正式上线“城际铁路公交化多元支付票务系统”。届时，广州地铁集团所辖城际铁路将全面支持“城际铁路公交化多元支付+12306”双票务系统。
据了解，“城际铁路公交化多元支付”功能在穗深城际铁路上线后，旅客搭乘穗深城际铁路可通过广州地铁APP城际乘车码，或使用已实名认证的全国交通一卡通、岭南通、羊城通等支付方式，在站内红色闸机处刷卡或扫码进站乘车，无需提前购票。同时，穗深城际铁路将停止支付宝12306小程序扫码乘车、铁路e卡通扫码乘车两项功能。需要注意的是，首次使用城际铁路公交化多元支付票务系统的旅客，需提前完成实名注册。
此外，城际东莞西站将同步完成站内升级改造。改造后，该站付费区将实现连通，旅客乘坐城际铁路在东莞西站换乘时无需出闸，出行体验将进一步提升。